税務署では取り扱えない悪質な脱税事案については、国税局査察部が強制調査を行うことができる。裁判所からの令状に基づき強制調査を行い、検察に脱税犯人として告発する事務を行う。映画「
マルサの女」で一躍有名になったが、元々「マルサ」とは国税局における隠語であった。国税査察官を3年務めると
副検事選考試験の受験資格が与えられる。
課税部全体の基本方針の決定及び課税部各課の所掌事務・施策等についての総合調整を担当。また、資料情報の事務及び大口困難事案の調査等に関する事務の企画・立案、指導及び監督を担当。